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분석 가이드

데이터 준비

분석이 실패하는 이유의 대부분은 데이터가 들어오기 전에 정해집니다.

파일 형식

데이터 받는 형식 비고
시퀀싱 원자료 FASTQ (gzip 가능) paired-end 는 _R1/_R2 로 짝을 맞춥니다
발현 매트릭스 CSV / TSV 1열 유전자명, 이후 열이 샘플
샘플 정보 CSV 첫 열이 샘플 ID — 매트릭스의 열 이름과 정확히 같아야 합니다

자주 막히는 자리

샘플 이름이 어긋납니다. 매트릭스의 열 이름과 샘플 정보의 ID 가 한 글자라도 다르면 그 샘플은 조용히 빠집니다. 공백·대소문자·-_ 를 확인하십시오.

그룹이 하나뿐입니다. 비교할 그룹이 둘 이상이어야 차등발현을 계산합니다. 샘플 정보에 그룹 열이 있는지 보십시오.

반복이 없습니다. 그룹당 하나면 통계를 낼 수 없습니다. 최소 둘, 가능하면 셋 이상을 권합니다.

넣기 전에 확인할 것

  • 파일이 열리는가 (압축이 깨지지 않았는가)
  • 샘플 수가 기대한 수와 같은가
  • 결측이 얼마나 되는가 — 절반을 넘으면 그 샘플은 빼는 편이 낫습니다